Accueil || Parcours || Recherche || S'enregistrer || Mon Compte || Contacts || Aide || Langues
Escartin, Frédéric (2008) Etude des conséquences physiologiques de l'utilisation de la thymidylate synthase ThyX. Doctorat LOB, LOB, EP/X p.147.
plein texte indisponible sur cette archive. |
|
Autres Localisations: http://www.imprimerie.polytechnique.fr/Theses/Files/Escartin.pdf
Résumé
La conversion par les thymidylate synthases du désoxyuridine 5-monophosphate (dUMP) en désoxythymidine 5-monophosphate (dTMP) est une des étapes clés de la biosynthèse des désoxyribonucléotides pyrimidiques. Chez les procaryotes (bactéries et archées), il existe deux familles de thymidylate synthases non homologues : ThyA et ThyX. La distribution phylogénétique quasi-exclusive des deux familles est complexe et ne suit pas les relations phylogéniques entre les organismes. Les protéines de ces deux familles ne présentent aucune similarité de séquence, de structure et leurs mécanismes et efficacités catalytiques diffèrent.
Les travaux présentés dans cette thèse ont permis de montrer que lactivité de ThyX est essentielle à la survie de la bactérie Rhodobacter capsulatus en absence de thymidine exogène. A partir des résultats de tests de complémentation génétique et de la modélisation mathématique du métabolisme des folates nous avons pu mettre en évidence que seulement une faible activité dihydrofolate réductase était nécessaire à la survie des organismes utilisant ThyX. Dautre part, jai pu montrer par des approches génétiques et par létude statistique de plus de 400 génomes procaryotes que les organismes utilisant ThyX ont une réplication et un taux de croissance lents, et possèdent majoritairement un petit génome. Je propose un modèle dans lequel la faible activité catalytique de ThyX limite la réplication de lADN e!
t par conséquent lexpansion du génome. Enfin, jai étudié le métabolisme des pyrimidines chez la bactérie pathogène humaine, Helicobacter pylori. Jai pu en particulier mettre en évidence quen absence de voie de récupération de luracile, cette bactérie est capable de métaboliser un analogue toxique le 5-fluorouracile (5FU), utilisé comme anticancéreux. Jai par ailleurs montré que lorotate phosphoribosyltransférase de H. pylori était capable de restaurer lauxotrophie pour luracile dune souche dEscherichia coli indiquant que cette enzyme pourrait être responsable de la sensibilité de H. pylori au 5FU.
Les travaux présentés dans cette thèse ont permis une meilleure compréhension des conséquences physiologiques de lutilisation de la thymidylate synthase ThyX. Ils ont notamment permis dexpliquer la distribution apparemment sporadique des deux familles de thymidylate synthases dans le monde procaryote.
| Type d'EPrint: | Thèse (Doctorat) |
|---|---|
| Directeur de Thèse: | Liebl, Ursula |
| Date: | 26 Mai 2008 |
| Jury de Thèse: | De reuse, Hilde et Liebl, Ursula et Myllykallio, Hannu et Petit, Marie-Agnès et Radicella, Pablo et Schmitt, Emmanuelle et Sommer, Suzanne |
| Ecole Doctorale: | ED 447 ECOLE DOCTORALE DE L'ECOLE POLYTECHNIQUE |
| Discipline: | LOB |
| Fonds: | Ecole Polytechnique (EP/X) |
| Institution: | EP/X |
| Laboratoire: | LOB |
| Sujets: | 7. Sciences de la vie et ingénierie du vivant |
| Mots-clés libres: | Thymidylate synthase, ThyA, Thyx, Nucleotide metabolism, Helicobacter pylori, Genome evolution, Folate, Thymidylate synthase, ThyA, ThyX, Métabolisme des nucléotides, Helicobacter pylori, évolution des génomes, Folate |
| Code ID: | 4113 |
| Déposé par : | Laurence Vidament |
| Déposé le : | 29 Août 2008 |
Table des Matières
INTRODUCTION
Chapitre I. Le métabolisme des précurseurs des acides nucléiques
Chapitre II. Les génomes procaryotes
RESULTATS et DISCUSSION
Chapitre I. Thymidylate synthases et métabolisme des folates
Chapitre II. Thymidylate synthases et dynamique des génomes procaryotes
Chapitre III. Etude de deux étapes clés du métabolisme des pyrimidines chez H. pylori.
DISCUSSION GENERALE
Administrateurs de l'archive uniquement : éditer cet enregistrement